Παθολογικά φαίνεται πως είναι τα αίτια θανάτου του μικρού Παναγιωτάκη όπως δείχνουν οι ιστολογικές εξετάσεις που διενεργήθηκαν. Πρόκειται για ένα από τα πέντε παιδιά που συνδέονται με την υπόθεση της Αμαλιάδας όπου φέρεται να εμπλέκεται η 24χρονη Ειρήνη Μουρτζούκου.
Σύμφωνα με τα όσα μετέδωσε ο τηλεοπτικός σταθμός MEGA, οι ιστολογικές εξετάσεις του μικρού Παναγιωτάκη δείχνουν στον εγκέφαλο: «Εικόνα συμβατή με παρατεταμένη ισχαιμική υποξική προσβολή του εγκεφάλου, από ωρών προ του θανάτου».
Παράλληλα «στην περιοχή του τυφλού αναγνωρίζεται εκτενής απόλυση (με ερωτηματικό) νέκρωση της βλενογόννου. Μορφολογία συμβατή με ιογενή προέλευση».
Σχολιάζοντας το πόρισμα, ο ιατροδικαστής, Γρηγόρης Λέων αναφέρει: «Δεν υπάρχει αμφιβολία, ότι το εύρημα μιλά για έλλειψη οξυγόνου στον εγκέφαλο. Έχοντας την ισχαιμία που είναι προφανώς διάχυτη, πρέπει να βρούμε κεντρική δικαιολογία που να τη δικαιολογεί. Ταιριάζει απόλυτα με τις εργαστηριακές εξετάσεις. Στην περιγραφή δεν υπάρχει ερωτηματικό για το εύρημα στον εγκέφαλο. Ο εγκέφαλος είναι το όργανο – στόχος. Για κάποιο λόγο έχασε οξυγόνο. Το σημαντικότερο εύρημα, το εύρημα κλειδί, δηλαδή η αιτία θανάτου σχετίζεται με την ισχαιμία. Για κάποιο λόγο έχασε το οξυγόνο κεντρικά».